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從 0 到百萬億:三優生物智能分子庫的崛起之路

2025-01-28 13:20   來源: 大眾時報網

      在生物醫藥領域,技術的每一次革新都可能帶來治療手段的飛躍。三優生物的智能百萬億分子庫(AI-STAL)宛如一顆耀眼新星,歷經10年的砥礪奮進,從無到有,從弱到強,逐步構建起龐大而先進的技術體系,為藥物研發開辟出全新的道路。AI-STAL這一平臺不僅見證了生物技術的飛速發展,更預示了未來生物醫藥研究的新方向。

      2015年:AI-STAL 萌芽

      2015年是三優生物技術征程的起點,這一年致力于打造技術內核。在展示載體方面,科研團隊全力以赴,成功建立起擁有自主產權的展示載體。這一過程并非一帆風順,研究人員深入鉆研噬菌體展示技術,對各類質粒載體進行篩選、改造和優化,經過無數次的實驗與調整,終于構建出序列獨一無二的噬菌體展示質粒載體。這一成果不僅確保了三優生物在技術層面的自主可控,更成為后續一系列技術突破的重要基礎。同時,三優生物在分子庫概念設計上也展現出前瞻性的眼光,提出多途徑抗原庫和多種類分子庫概念設計。當時,傳統的抗原庫和分子庫構建思路較為單一,三優生物的科研人員通過對免疫學、分子生物學等多學科知識的融合與創新,設想從不同途徑獲取抗原,構建多種類型的分子庫,以滿足多樣化的藥物研發需求。

      2016年:商業啟航

      2016年,三優生物邁出了重要的商業化步伐。在技術整合上,團隊成功整合雜交瘤與噬菌體展示技術。雜交瘤技術能夠產生特異性強的單克隆抗體,但存在篩選效率低等問題;噬菌體展示技術則具有高通量篩選的優勢。三優生物的科研人員巧妙地將兩者結合,取長補短。他們先利用雜交瘤技術制備出具有初步特異性的抗體,然后通過噬菌體展示技術對這些抗體進行進一步篩選和優化,大大提高了抗體的質量和篩選效率。基于此技術,合成和半合成抗體庫的概念設計也得以推進。團隊創新性地提出通過人工合成和半合成的方式構建抗體庫,以增加抗體的多樣性和特異性。在商業化應用方面,三優生物成為中國小鼠免疫庫商業化應用先驅。他們將自主研發的小鼠免疫庫推向市場,為眾多科研機構和藥企提供了高效的抗體篩選工具,在行業內迅速積累了良好的口碑和影響力。

      2017年:技術夯實

      2017年,三優生物著重于技術基礎的夯實。在千億全人抗體庫概念設計上,團隊深入研究全人抗體的結構和功能特點,結合先進的基因合成和克隆技術,設想構建一個包含千億級別的全人抗體庫。通過大量的前期調研和實驗模擬,確定了庫的構建方案和技術路線。同時,共同輕鏈庫的概念設計也同步展開。科研人員發現,在抗體構建過程中,輕鏈的穩定性和兼容性對抗體性能有著重要影響,于是提出構建共同輕鏈庫的設想,旨在為后續的抗體開發提供更加穩定和高效的輕鏈來源。此外,小鼠免疫抗體庫也得到進一步升級。通過優化免疫方案和篩選流程,提高了抗體庫中抗體的親和力和特異性,使其在藥物研發中的應用價值得到進一步提升。

      2018年:AI-STAL 1.0起步

      2018年是三優生物在初代文庫探索上取得重大突破的一年。團隊成功構建了千億全人抗體庫,這一成果創下記錄。在構建過程中,面臨著基因合成難度大、文庫構建效率低等諸多挑戰。科研人員通過優化基因合成方法,采用高效的克隆技術和篩選策略,克服了重重困難,成功構建出分子數量數倍于百億抗體庫的千億全人抗體庫。隨著庫容的顯著提升,優選先導分子的數量大幅增加,為藥物研發提供了更多優質的候選分子。同年,百億單域天然庫也成功構建并創下記錄。當時,全球單域抗體的最大庫容僅為40多億,三優生物憑借其先進的技術平臺和創新的構建思路,突破了這一限制。團隊從羊駝等動物體內獲取單域抗體基因,通過優化基因克隆和表達條件,成功構建出百億級別的單域天然庫。年底,還完成了十億級共同輕鏈庫的構建。這一過程中,科研人員對輕鏈基因進行精細篩選和組裝,確保了共同輕鏈庫的質量和穩定性,為后續萬億級共同輕鏈抗體庫的開發奠定了堅實基礎。

      2019年:單域文庫開發

      2019年,三優生物在單域文庫開發領域取得顯著進展。萬億全人抗體庫概念設計穩步推進,團隊通過對千億全人抗體庫的數據分析和技術總結,提出了構建萬億全人抗體庫的設想。他們計劃通過進一步優化基因合成和文庫構建技術,增加抗體的多樣性和復雜性。同時,成功構建了超千億單域抗體庫,再次創下記錄。在構建過程中,科研人員引入了新的合成技術和篩選方法,提高了單域抗體庫的質量和篩選效率。此外,十億共同輕鏈庫驗證完成。通過一系列嚴格的實驗驗證,證明了該庫在抗體構建中的穩定性和有效性,為后續的抗體開發提供了可靠的輕鏈來源。

      2020年:深度技術升級

      2020年,三優生物迎來深度技術升級。在人源化半合成概念設計上,團隊基于對人體免疫系統和抗體結構的深入理解,提出通過人工合成和基因改造相結合的方式,構建人源化半合成抗體庫。他們設想在保留抗體天然活性的基礎上,提高抗體的人源化程度,降低免疫原性。人源化單域概念設計也同步展開,科研人員針對單域抗體的特點,通過對單域抗體骨架進行人源化改造,構建人源化單域抗體庫,以提高單域抗體在人體中的應用安全性和有效性。共同輕鏈庫概念設計也得到進一步深化,團隊從分子層面深入研究共同輕鏈的結構和功能,為構建更加高效的共同輕鏈庫提供理論支持。

      2021年:三大萬億庫建成

      2021年是三優生物具有里程碑意義的一年,成功建成三大萬億庫。萬億全人重組抗體庫的建成創下記錄,團隊在構建過程中,采用了先進的基因重組技術和高效的文庫篩選方法,確保了庫中抗體的多樣性和高質量。萬億全人半合成抗體庫也順利建成,這是在萬億全人抗體庫基礎上,通過 CDR 間的基因重組實現的升級。科研人員利用精準的基因編輯技術,對抗體的互補決定區(CDR)進行重組優化,提高了抗體的特異性和親和力。萬億人源化單域抗體庫同樣創記錄建成,該庫基于高度人源化的單域抗體骨架,參照自然界的 CDR 序列特點,通過精準定向合成的方式構建而成。同年,首個萬億級分子庫的篩選驗證取得優異成果,針對單個靶點蛋白,平均先導分子數量高達數百個,且多樣性極高,為藥物研發提供了豐富的優質候選分子。

      2022年:超萬億平臺上線

      2022年,三優生物在分子庫建設和平臺整合方面取得新突破。萬億全人共輕庫成功構建并創下記錄,該庫能有效解決“Two in one”類雙抗構建中的輕重鏈錯配難題,為雙抗、雙靶或雙表位 ADC 等抗體的開發提供了有力支持。至此,三優生物的四個萬億庫的庫容累積達到了七萬億的超大規模。同年6月3日,三優生物將超萬億分子庫及相關技術整合為平臺,并命名為“三優超萬億創新抗體藥發現平臺”(STAL),正式對外發布。這一平臺整合了多種先進技術和豐富的分子庫資源,為藥物研發提供了一站式解決方案。與此同時,千億環形多肽分子庫的構建及驗證也順利完成。科研人員通過創新的多肽合成技術和篩選方法,構建出具有獨特結構和功能的環形多肽分子庫,為多肽藥物研發開辟了新的方向。

      2023年:庫容飛躍

      2023年,三優生物的超萬億分子庫庫容實現飛躍。萬億多肽庫成功構建并創下記錄,團隊在多肽合成技術和文庫構建方法上取得新突破,使得庫容達到三萬億。至此,超萬億分子庫的累計庫容突破了十萬億。同年10月,對超萬億創新生物藥發現平臺進行了系統的總結和發布,進一步完善了平臺的功能和服務體系。同年年底,完成了千億新型 Anti - Calin 分子庫的構建及驗證。Anti - Calin 分子具有獨特的結構和功能,在靶向治療領域具有廣闊的應用前景,該庫的構建為相關藥物研發提供了重要的分子資源。

      2024年:AI 輔助設計

      2024年,三優生物引入 AI 技術助力分子庫設計。第二代超萬億單域庫的概念驗證率先啟動,團隊利用 AI 算法對單域抗體的結構和功能進行分析和預測,優化庫的構建方案。通過大量的模擬實驗和數據分析,確定了第二代超萬億單域庫的構建方向和技術要點。同年10月,完成了第二代超萬億單域庫概念庫的構建及驗證。目前,第二代萬億級單域抗體庫正在緊鑼密鼓地構建中。同時,第二代超萬億多肽庫的構建工作也在積極推進。團隊借助 AI 技術,對多肽的序列和結構進行優化設計,提高多肽庫的質量和篩選效率。此外,核酸分子庫概念設計也提上日程,科研人員設想利用 AI 技術設計和構建具有特定功能的核酸分子庫,為基因治療等領域提供新的技術手段。

      2025年:AI-STAL 2.0 起步

      2025年1月,AI-STAL 2.0 正式啟動,計劃經過數年的努力,完成智能百萬億分子庫的構建及逐步上線。計劃新增10萬億新型單域庫上線,充分融合 AI 技術,通過 AI 算法對單域抗體的基因序列進行優化設計,提高了新型分子庫中抗體的多樣性和特異性。同時,實現了 AI 在抗體發現和優化的全流程打通。從抗體基因的設計、文庫的構建,到抗體的篩選和優化,AI 技術貫穿始終。利用 AI 算法對大量的生物學數據進行分析和挖掘,快速準確地發現潛在的抗體分子,并對其進行優化改造,大大提高了抗體研發的效率和成功率。

      未來展望

      展望未來,AI - STAL 2.0 將朝著更加廣闊的方向發展。在發展方向上,面向5大方向,包括適應癥、分子形式、應用場景、小程序和重要靶標。在分子種類上,涵蓋6類分子,包括全人單克隆抗體、共同輕鏈抗體、人源化單域抗體、環狀多肽分子、ADC分子和mRNA分子,為不同疾病的治療提供多樣化的分子工具。在應用場景上,適配8大場景,包括ELISA,WB,IHC,IF,IP-ID,FC,SPA,SPB。在技術融合上,融合7項 AI 程序,包括從頭生成,表位預測,免疫原性預測,成藥性預測,特異性預測,親和力預測,one-click 分子設計,提升研發的智能化水平。在疾病研究上,深耕9大人類疾病,包括腫瘤、自免、感染、代謝、眼科、神經、心血管、抗衰老及各種罕見病。在靶標探索上,針對10萬重要靶標展開深入研究,為開發更多創新藥物奠定堅實基礎。

      三優生物的智能百萬億分子庫(AI-STAL)從2015年的萌芽起步,歷經10年的不懈努力和技術創新,已發展成為生物制藥領域的強大技術平臺。未來,隨著 AI 技術的深度融合和不斷拓展,必將在攻克人類重大疾病、開發創新藥物等方面發揮更加重要的作用,為人類健康事業做出卓越貢獻。


責任編輯:劉明德
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